MongoDB作為一種流行的開源數據庫，盡管它擁有許多優點，但它也有一些缺點，同樣需要被討論和考慮，以使用者能夠在做出決定時具有相應的了解。

首先，MongoDB的性能并不是太高，盡管它的性能提高的空間還是很大的，但它相比于其他數據庫要低一些，在復雜的數據結構中，如果數據量非常大，對性能可能會帶來負面影響。其次，MongoDB幾乎沒有完整的事務處理機制，這是一種安全特性，它在許多數據庫系統里是默認存在的，但是MongoDB不支持事務處理，只提供簡單的原子操作，并且沒有內置的方法控制一致性，也少有一致性模型。

此外，MongoDB也可能會遇到容量和空間的限制，根據文檔的大小，集合的文檔可以有不同的尺寸限制，超過此尺寸，就可能會有更多的空間，而且使用者需要浪費時間單獨管理空間，空間的管理也會受到限制，這是不可能的。此外，MongoDB的安全性也被質疑，某些試驗結果表明，MongoDB可能會在某些情況下受到攻擊，導致數據被損壞或泄露。

整體來說，MongoDB的這些缺點都會對其使用者產生一定的影響。首先，性能低于其他數據庫，可能會影響到交互性能以及應用的數據處理速度。其次，缺乏完整的事務處理機制，可能會嚴重影響數據的安全性。此外，容量和空間的限制也會影響到數據管理，因為數據可能會在一些重要場合無法正常使用。同樣，MongoDB可能存在更多安全性漏洞，這可能會嚴重影響用戶的數據安全。

因此，MongoDB也存在一些缺點，使用者需要知道這些缺點，并在做出選擇時考慮到這一點。雖然它仍然是一種流行的數據庫，但用戶需要了解相關的缺點，以較好的做出選擇。